Ziemeļvidzemes biosfēras rezervātā ir 1 dabas parks:
- Salacas upes ieleja (Natura 2000 teritorija)
Ziemeļvidzemes biosfēras rezervātā ir 3 dabas liegumu zonas:
- Ziemeļu purvi (Natura 2000 teritorija),
- Vidusburtnieks (Natura 2000 teritorija),
- Augstroze (Natura 2000 teritorija)
Ziemeļvidzemes biosfēras rezervātā ir 24 dabas liegumi:
- Randu pļavas (Natura 2000 teritorija)
- Vidzemes akmeņainā jūrmala (Natura 2000 teritorija)
- Mērnieku dumbrāji (Natura 2000 teritorija)
- Smilšu krupja atradne Karatereros
- Vitrupes ieleja (Natura 2000 teritorija)
- Kalna purvs (Natura 2000 teritorija)
- Lielpurvs (Natura 2000 teritorija)
- Niedrāju-Pilkas purvs (Natura 2000 teritorija)
- Dziļezers un Riebezers (Natura 2000 teritorija)
- Pirtsmeža purvs (Natura 2000 teritorija)
- Limšānu purvs (Natura 2000 teritorija)
- Ungurpils meži (Natura 2000 teritorija)
- Dūņezers (Natura 2000 teritorija)
- Maizezers (Natura 2000 teritorija)
- Purgaiļu purvs (Natura 2000 teritorija)
- Dzērves purvs (Natura 2000 teritorija)
- Klagatu purvs (Natura 2000 teritorija)
- Rūjas palienes (Natura 2000 teritorija)
- Burtnieka ezera pļavas (Natura 2000 teritorija)
- Zilais kalns (Natura 2000 teritorija)
- Oleru purvs (Natura 2000 teritorija)
- Kārķu purvs (Natura 2000 teritorija)
- Sedas purvs (Natura 2000 teritorija)
- Burgas pļavas (Natura 2000 teritorija)
